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  3. Tag : littérature scientifique

Tag: littérature scientifique

Tous CEILNPQU
Résultats : articles 1 à 14 sur 14

IA : un nouveau paradigme pour la recherche documentaire scientifique ?

Tags
Intelligence artificielle | littérature scientifique | veille technologique
François LIBMANN
Bases no
444
publié en
2026.02
2064
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IA : un nouveau paradigme pour la recherche documentaire ... Image 1

On avait fini par penser que la recherche dans la littérature scientifique et les brevets était intimement et irrévocablement réalisée avec des outils de logique booléenne plus ou moins sophistiqués. Nous allons voir dans cet article qu’une approche alternative est maintenant disponible et donne des résultats intéressants. Nous allons présenter dans cet article plusieurs nouveaux outils, ainsi que d’autres à venir dans les prochains numéros de BASES.

Cinquante ans de recherche booléenne : un modèle qui n’a guère varié

On peut dater à 1972 (date de début de commercialisation du serveur Dialog au sein de la société américaine Lockheed) la mise en place de la recherche dans des corpus de littérature scientifique en utilisant une logique booléenne sur des documents préalablement indexés.

À mesure que la puissance informatique devenait disponible, l’utilisation de cette logique booléenne a permis de construire des requêtes d’une très grande complexité combinant jusqu’à plus de 100 étapes.

Durant de nombreuses décennies, ce domaine de recherche s’est étendu grâce à l’enrichissement substantiel des corpus, notamment par la création de centaines de banques de données spécialisées disponibles sur divers serveurs, ainsi que par l’émergence de systèmes globaux tels que Scopus ou Web of Science .

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Enfin un guide d’utilisation de la base OpenAlex

Tags
web of science | littérature scientifique | science ouverte | Scopus
1767
Enfin un guide d’utilisation de la base OpenAlex Image 1

OpenAlex, lancé en janvier 2022, est un catalogue bibliographique de la recherche scientifique mondiale dont le nom fait référence à la légendaire Bibliothèque d’Alexandrie.

Son ambition affichée est de constituer une alternative crédible aux bases de données commerciales Scopus (Elsevier) et Web of Science (Clarivate), auxquelles il est reproché leur coût élevé et une couverture thématique sélective. Ces deux acteurs historiques — Scopus depuis 2004, Web of Science depuis des décennies — ont accumulé au fil du temps des rancœurs croissantes au sein de la communauté scientifique.

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IA vs littérature : l’intelligence artificielle menace-t-elle vraiment les écrivains ? 

Tags
Intelligence artificielle | littérature scientifique | droit d'auteur
1866
IA vs littérature : l’intelligence artificielle ... Image 1

L’intelligence artificielle peut désormais écrire des textes en quelques secondes, de quoi inquiéter les écrivains. Faut-il craindre la fin de la littérature humaine ?

Depuis quelques années, l’intelligence artificielle s’invite partout : dans nos téléphones, nos études, notre travail… et désormais dans l’écriture. Capable de produire des textes en quelques secondes, l’IA générative interroge et inquiète le monde littéraire. Peut-elle réellement remplacer les écrivains ? Ou s’agit-il d’une peur amplifiée par une technologie encore mal comprise ? Un récent rapport mené par l’Université de Cambridge, relayé le journal BBC, apporte des éléments de réponse, et surtout, met en lumière les craintes très concrètes des romanciers. 

Une peur largement partagée chez les auteurs

Selon ce rapport, les écrivains sont loin d’être sereins face à l’essor de l’IA. Sur les 332 auteurs interrogés par le Dr Clémentine Collett, chercheuse au Minderoo Centre for Technology & Democracy (MCTD) de l’Université de Cambridge, près de la moitié estiment que l’IA pourrait « remplacer entièrement » leur travail. 

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Qu'est-ce que l'autoplagiat ? Maîtrisez ce concept insolite pour valoriser votre thèse en toute légalité

Tags
littérature scientifique | archives ouvertes | droit d'auteur | recherche publique
1558
Qu'est-ce que l'autoplagiat ? Maîtrisez ce concept insolite ... Image 1

Lorsqu’on a soutenu une thèse, on peut penser – naïvement, comme on va le voir – que l’on dispose librement de son contenu et que l’on peut donc en faire ce que l’on veut. En particulier, il semble évident que l’on puisse publier des articles scientifiques reprenant des éléments de ce travail. Pourtant, une menace inattendue guette le jeune docteur : celle de l’autoplagiat.

Cette notion peut, de prime abord, paraître quelque peu baroque. Nous pensions en effet que le plagiat consistait à s’approprier le travail d’autrui et que, par définition, il était impossible de se plagier soi-même. Or nous avons découvert que ce n’était pas le cas et même que l’autoplagiat pouvait avoir de graves conséquences.

L’existence de ce concept ne doit toutefois pas dissuader un chercheur de publier des articles scientifiques issus de sa thèse. Rappelons que celle-ci est nécessairement diffusée depuis 2016 – au moins signalée en cas d’embargo – sur theses.fr et, le cas échéant, sur HAL. Publier à partir de sa thèse est donc parfaitement possible, mais cela suppose de respecter un certain nombre de conditions afin d’éviter toute accusation d’autoplagiat.

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L’édition scientifique va-t-elle dans le mur ?

Tags
Intelligence artificielle | littérature scientifique | veille technologique | science ouverte
FRANÇOIS LIBMANN
Bases no
442
publié en
2025.12
1781
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L’édition scientifique va-t-elle dans le mur ? Image 1

Depuis plusieurs siècles les publications scientifiques sont un des fondements de l’évolution de la science. En effet, le plus ancien périodique scientifique le Journal des sçavans  est paru à Paris le 5 janvier 1665.

Aujourd’hui plusieurs signes inquiétants viennent mettre en doute la possibilité pour ce système de poursuivre son évolution de façon harmonieuse et de continuer à accompagner l’avancement de la science comme il l’a fait jusqu’à présent.

Une illustration en est la journée 2025 Science ouverte du CNRS sur le thème « La mort annoncée des publications scientifiques ? .

Une croissance incontrôlée

Le nombre de publications scientifiques croît nettement plus rapidement que le nombre de chercheurs. Par exemple, entre 2016 et 2020 les principales bases de données bibliographiques ont grossi de 50 % alors que le nombre de scientifiques n’augmentait que de 16 %. C’est ce qu’on lit dans le BlogCNRS du 16 décembre 2025 intitulé « Publications scientifiques : une surproduction fatale ? ».

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La recherche sur les valeurs des propriétés physiques

Tags
derwent | littérature scientifique | veille technologique | brevets
François LIBMANN
Bases no
442
publié en
2025.12
1632
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La recherche sur les valeurs des propriétés physiques Image 1

La recherche sur les valeurs d’une grandeur physique à l’intérieur d’un texte, qu’il s’agisse d’un article ou d’un brevet, ne s’utilise a priori pas tous les jours.

En revanche, quand il est utile de l’employer cela apporte une plus-value certaine, car cela rajoute une possibilité de recherche de nature différente permettant de répondre à une autre série de questions.

Plusieurs systèmes proposent aujourd’hui ce type de recherche d’une façon développée. Nous en avons identifié chez trois des grands serveurs et une banque de données qui fait partie des classiques.

Le serveur STN : une offre depuis 2013 avec sa « Numerical property search » (NPS)

Elle est disponible dans 15 banques de données offrant le texte intégral des brevets (EP et PCT plus12 pays) ainsi que dans Derwent World Patent Index et RDisclosure, la base des publications défensives (voir l’article sur les publications défensives dans BASES N° 325, avril 2015).

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PubMed.ai et les outils d’IA en recherche biomédicale

Tags
recherche biomédicale | Intelligence artificielle | littérature scientifique | veille technologique
François LIBMANN
Bases no
440
publié en
2025.10
2494
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PubMed.ai et les outils d’IA en recherche biomédicale Image 1

L’arrivée de PubMed.ai s’inscrit dans un écosystème en pleine expansion d’outils d’intelligence artificielle dédiés à l’exploration de la littérature scientifique biomédicale. Face à ces innovations technologiques, les enjeux demeurent la sélection rigoureuse des sources et la fiabilité des réponses par rapport aux pratiques manuelles traditionnelles supervisées par des experts humains.

Une concurrence féroce dans l’IA biomédicale

Peu après le lancement remarqué d’Embase AI par Elsevier, la NCBI (National Center for Biotechnology Information) a riposté en déployant PubMed.ai en version bêta. Cet outil propose des résumés générés par IA et des analyses synthétiques.

Cependant, face au déluge de références bibliographiques, ces solutions représentent-elles véritablement l’assistant idéal pour les chercheurs, ou constituent-elles plutôt un mirage technologique ?

La mortalité élevée des outils spécialisés

L’histoire récente révèle une hécatombe d’outils alors prometteurs : AskMEDLINE lancé en 2004 par la NLM), Semantic MEDLINE (NLM 2011-12), et FACTA+ (Université de Tokyo - 2023)… Nombreux sont ceux qui ont disparu avec l’évolution technologique accélérée. Parmi les survivants comme LitVar ou LitSense, lesquels parviendront à révolutionner la recherche sur les variants génétiques sans sombrer dans l’oubli ?

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Comment s’assurer d’une review positive, voire très positive ?

Tags
littérature scientifique | veille medias | archives ouvertes | fact checking
François LIBMANN
Bases no
439
publié en
2025.09
2107
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Comment s’assurer d’une review positive, voire très ... Image 1

On n’est jamais si bien servi que par soi-même…, c’est la conclusion que l’on peut tirer de la lecture du récent article du NIKKEIAsia « Invisible prompts in manuscripts: Authors use AI ‘prompt injection’ to sway peer review ».

Les auteurs de l’article de NIKKEIAsia ont découvert que de petits malins, auteurs ou co-auteurs de 17 articles, en attente de review, présents dans arXiv - le bien connu et plus ancien réservoir de preprints - ont trouvé un moyen de « forcer » une IA à donner une excellente évaluation de leur article.

L’objectif de la manipulation : permettre ou au moins faciliter la publication de l’article dans un journal de bonne réputation ou l’acceptation d’une soumission d’une conférence à un congrès.

Comment s’y sont-ils pris ?

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Préserver l’intégrité de la science : un guide pratique et accessible

Tags
littérature scientifique | science ouverte | recherche publique | fact checking
2327
Préserver l’intégrité de la science : un guide pratique et ... Image 1
Savoir repérer les dérives

L'intégrité scientifique peut être compromise de multiples façons. Parmi les écueils les plus fréquents, on retrouve le plagiat, la manipulation d'images, l'abus d'auto-citations, un recours excessif à des articles rétractés, ou encore l'utilisation de données peu fiables ou incohérentes.

Mais comment identifier ces dérives ? Et surtout, que faire lorsqu’on en repère une dans un article ? Aujourd’hui, des outils existent pour aider chacun – chercheur, lecteur ou professionnel de l'information – à vérifier, signaler ou mieux comprendre les écarts. Cette pratique, appelée relecture post-publication (Post Publication Peer Review), gagne du terrain. Elle a d’ailleurs fait l’objet d’un article dans BASES N° 433 - mars 2025. 

Le COSIG un guide complet détaillé

Pour accompagner ces démarches le Center for Open Science dont la mission est, en particulier, de contribuer à l’intégrité de la science vient de publier une mise à jour de son guide de référence le COSIG (Collection of Open Science Integrity Guides) .

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Les peer reviews des articles de NATURE sont maintenant disponibles

Tags
protocole | littérature scientifique | science ouverte
2800
Les peer reviews des articles de NATURE sont maintenant ... Image 1

Nous avons évoqué dans le numéro 434 de BASES (Mars 2025) le développement, pour les articles de recherche scientifique, du » post publication peer review  » c’est à dire la revue par les pairs après publication et non pas avant, comme c’est traditionnellement le cas.

Un des arguments avancés pour justifier cette démarche, qui s’est répandue plutôt rapidement, était le caractère confidentiel et obscur du processus de « peer review ». 
Cet argument vient de tomber, au moins en partie, car l’éditeur Springer Nature vient d’annoncer, qu’après une période concluante de tests qui a duré plusieurs années, tous les articles de 16 publications (voir ci-dessous) éditées par Springer Nature comporteront une annexe reprenant en détail le dialogue entre les reviewers et l’auteur, cette démarche étant appelée « transparent peer review ». On y trouve l’intégralité des questions et des réponses.

Ce sont des documents extrêmement intéressants car les reviewers analysent l’article dans le détail, posent des questions précises et font des remarques pertinentes.
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Le danger des articles de recherche médicale frauduleux

Tags
littérature scientifique | ist | biomédical | fake news | information scientifique et technique
 François LIBMANN
Bases no
436
publié en
2025.05
2585
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Le danger des articles de recherche médicale frauduleux Image 1

En 2009 les lignes directrices de la société européenne de cardiologie recommandaient l’usage des bêta bloquants pour protéger le cœur lors d’opération non cardiaque. Ces lignes directrices étaient déduites d’une série d’études menées depuis 1999. Ces directives ont été modifiées en 2013 à la suite d’une « expression of concern » publiée dans L’European Heart Journal recommandant que ces lignes directrices ne dussent plus être appliquées en routine, mais faire l’objet d’une analyse au cas par cas.

En effet, un article publié en 2014 “ Meta-analysis of secure randomised controlled trials of β-blockade to prevent perioperative death in non-cardiac surgery “ de Bouri, S., Shun-Shin, M. J., Cole, G. D., Mayet, J. & Francis, D. P. Heart 100 , 456-464 (2014). a remis drasti­quement en cause les essais réalisés par l’organisme néerlandais DECREASE qui constituaient le socle de ces lignes directrices. Les auteurs ont utilisé pour cela une autre série d’études considérées, elles, comme sûres, réalisées sur un total de 10 529 patients. Les résultats ont montré que l’application des directives de 1999 augmentait la mortalité à 30 jours de 27 %. Les auteurs ont donc recommandé d’abroger sans délai les recommandations de 1999. D’autres auteurs ont considéré que ces mauvaises lignes directrices étaient responsables de jusqu’à 10 000 décès par an au Royaume-Uni.

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Préprints biomédicaux : bioRxiv et medRxiv intègrent openRxiv, une structure de gouvernance indépendante

Tags
abstracts | littérature scientifique | science ouverte | ist | biomédical | information scientifique et technique | open access
François LIBMANN
Bases no
435
publié en
2025.04
2694
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Préprints biomédicaux : bioRxiv et medRxiv intègrent ... Image 1

L’écosystème des préprints dans le domaine biomédical connaît une évolution majeure avec la création d’openRxiv, une structure indépendante à but non lucratif destinée à piloter et développer les serveurs de préprints bioRxiv et medRxiv. 

Ces deux plateformes publient les articles scientifiques qui leur sont soumis dès que leurs auteurs les jugent comme terminés, sans attendre une peer review pour décider de la publication dans le journal auquel ils auraient été envoyés. En effet, les délais avant décision peuvent atteindre plusieurs mois et parfois dépasser un an.

● bioRxiv a été créé en 2013 et propose aujourd’hui environ 274 000 documents écrits par 970 000 auteurs, et 4 000 nouveaux documents sont ajoutés chaque mois.

● Pour sa part, medRxiv a été créé en 2019 et propose aujourd’hui près de 66 000 documents écrits par plus de 380 000 auteurs, et 1 000 nou­veaux documents sont ajoutés chaque mois.

Ces deux plateformes ont joué un rôle important pendant la pandémie de COVID 19 au cours de laquelle la diffusion rapide de l’information scien­tifique a été cruciale.

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Une nouvelle forme de peer review se développe rapidement

Tags
abstracts | littérature scientifique | science ouverte | ist | archives ouvertes | références bibliographiques | biomédical | information scientifique et technique | open access
FRANÇOIS LIBMANN
Bases no
434
publié en
2025.03
4538
Acheter le numéro
Une nouvelle forme de peer review se développe rapidement Image 1

Le peer review d’un article académique est, traditionnellement, une revue par les pairs avant publication. Il reste le fondement du fonctionnement de la majorité des éditeurs, qu’ils publient selon le schéma traditionnel dans lequel le lecteur paie en s’abonnant, ou qu’ils publient en open access, schéma dans lequel l’auteur, son institution ou un sponsor règle les frais (Article processing charges, soit APC).

Les limites du peer review traditionnel

Si cette procédure est supposée garantir aux articles publiés un haut niveau de qualité, elle présente l’inconvénient majeur d’imposer un délai parfois long entre le dépôt du manuscrit et la publication effective de l’article.

Cela devient de moins en moins supportable alors même que les développe­ments de la recherche connaissent une accélération significative comme on a pu le constater, en particulier, lors de la pandémie du COVID-19.

S’ajoute la difficulté croissante à trouver des reviewers (en règle générale bénévoles) disponibles, conséquence à la fois de l’inflation du nombre de publications et de la pression que subissent les chercheurs pour publier toujours plus, ce qui leur laisse moins de temps pour se consacrer aux reviews.

Et enfin, rien ne garantit que deux ou trois reviewers (au mieux) auront pu détecter toutes les failles potentielles d’un article. En effet, ces failles pourraient n’apparaître que lorsqu’un nombre plus important de scientifiques aura pu en prendre connaissance.

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Nous avons testé le Web of Science Research Assistant

Tags
web of science | littérature scientifique | IA
François LIBMANN
Bases no
428
publié en
2024.09
2829
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Nous avons testé le Web of Science Research Assistant Image 1

Après neuf mois de tests auprès de la communauté des utilisateurs de Web of Science, Clarivate vient d’annoncer le lancement de son assistant de recherche dopé à l’IA pour la recherche sur le contenu de Web of Science Core qui propose 92 millions de références dans le domaine scientifique depuis le début du 20° siècle.

Nous avons testé ce nouvel outil qui illustre l’investissement des serveurs et agrégateurs dans des possibilités de recherche nouvelles sur leur fonds grâce à l’intelligence artificielle.

Interface et options de recherche

L’écran d’accueil est commun avec la recherche classique sur le Web of Science. L’accès se fait par un clic sur « Search assistant » qui donne accès à la nouvelle interface. On se voit alors proposer quatre options qui correspondent à autant de problématiques.

La première baptisée « Start a new search by asking a question » permet de lancer une question spécifique en langage naturel. « C’est une méthode intuitive pour commencer une exploration, particulièrement utile pour les chercheurs qui ne sont pas familiers avec les techniques de recherche avancées. »

La seconde, « Understand a topic » a pour objectif d’offrir rapidement une vue d’ensemble structurée d’un sujet spécifique. C’est un excellent point de départ pour se familiariser rapidement avec un nouveau domaine de recherche ».

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